安全放心的免费绿色软件下载网站!

Vector NTI序列比对软件v10.3 版

类型: 工具 平台: 安卓 语言: 简体中文 授权: 免费软件 大小: 108.5M 更新: 2022-11-27 10:08:28
点击下载

  Vector NTI序列比对软件是一款非常好用的实验设计软件,能够帮助用户轻松进行各种实验的设计,有效的减少了试验次数,优化实验结果,使用起来十分方便快捷,感兴趣的朋友不要错过了,欢迎大家下载体验。

Vector NTI序列比对软件

软件特色

  从AlignX出口分子

  在文本窗格中选定的分子可以出口到GenBank、EMBL(GenPept蛋白质)(SWISS-PROT蛋白质),或为原序列fasta文件。若要将分子导出到外部文件,请选择项目>导出分子,并在“文件保存”对话框中选择文件类型。

  得分矩阵-- AlignX

  设计成对序列比对评估的所有算法都是基于将分数分配给对齐残基的系统,检测不同序列之间的相似性。众所周知,某些氨基酸在其他相关蛋白质中很容易被其他氨基酸取代,这可能是因为它们具有相似的理化性质。根据氨基酸被替换为原始残基的相似性,这些“替换”被分配在矩阵中显示的分数。在对齐分数上相同或相似的残留物比那些不太相似的残留物高

  比对pcr分析报告

  当搜索完成时,如果您在结果选项卡上检查了生成报告选项,则对齐PCR报告预览窗口显示分析结果。比对PCR分析报告对话框的外观和功能类似于多重PCR分析报告对话框。

  关于点阵

  点阵分析主要是比较两个序列来寻找所有可能的残基匹配的方法。该方法还可用于蛋白质和DNA序列中的直接或反向重复序列。它可以预测RNA中自我互补的区域,从而形成双链区或二级结构。

  分析bioannotator

  bioannotator是一套全面的蛋白质和核酸序列分析工具,超过五十种不同的预定义的蛋白表与特征映射和序列提供。bioannotator还提供以下先进的搜索和分析工具,它是运行在分析监控:PROSITE,Pfam,块和蛋白水解裂解。

  通过Web执行分析

  Vector NTI使得它很容易把你的alignx数据直接到公共网站已经建立了一个分子的三维结构,比较它与其他分子,特定功能的搜索,或进行基因预测,等等。

软件功能

  分析GenomBench

  genombench是Vector NTI提前的基因组项目的主力。genombench可以容纳一个碱基的基因组片段,可以检索从兼容的系统兼容的服务器上的数据,例如UCSC和Ensembl。它提供了浏览和查询这些网站使用关键词,界面两侧标记,BLAT(UCSC数据库)或SSAHA(的)。genombench还提供以下先进的搜索和分析工具,它是运行在分析监控

  对分子序列的操作

  我们以一个DNA序列为例,进行一系列的常规分析;最后将此DNA序列翻译成氨基酸序列,并对此氨基酸序列进行各种分析。

  对齐显示设置――Consensus Calculation Tab

  一致性序列是一个理论上有代表性的核苷酸序列,其中每个核苷酸代表在同一位点上在同一位点上经常看到的残基,或由其他标准选择。“对齐设置”对话框中的“一致性计算”选项卡指定如何以对齐方式计算对齐窗格中作为底部序列的一致序列。

  以点击作为特征输出查询分子

  当您导出查询显示为特征的分子打成。GFF文件,使用点击功能GFF文件命令导出查询分子保存。GFF文件到外部位置(硬盘、软盘、网络等)。你可以打开一个。在一个Vector NTI分子视窗GFF文件并将其保存到Vector NTI数据库,如果需要的话。。GFF文件提供一个共享查询爆破方法打信息与其他Vector NTI用户分子格式。

  模拟电泳

  模拟电泳是指对DNA片段进行酶切分析后,通过电脑模拟电泳过程,将酶切片段分离。该功能有利于评估电泳时间,便于验证实际电泳结果的好坏。

使用说明

  (一)导入外源序列的方法

  点击Project菜单中Add Files命令,选择需要比较的序列文件,点击打开按钮,确认是DNA/RNA还是Protein Sequence后,点击Import按钮就可以完成序列的导入任务。

  (二)以演示Project来讲述AlignX的使用

  1.选择Project菜单Open命令,找到Vector NTI的Demo Projects文件夹,打开DNA.apr文件;

  2.在文本窗口中,使用鼠标左键双击任一文件名,就可以得到该文件的所有基本信息;

  3.建立一个新的比较策略并进行比较:

  ①在文本窗口中,按住Ctrl键选中四个序列:AF××××

  ②点击Alignment菜单中Alignment Setup命令,出现Alignment Setup对话框,在此对话框中有30个选项来确定最终比较结果展示方式,这里我们使用默认值即可。

  ③点击Alignment菜单中的Align Selected Sequence命令,片刻后程序完成比较并给出结果和进化树;

  ④在View菜单中,我们可以通过Edit Alignment命令来编辑比较结果,使用Display Setup命令来改变结果的展示方式和颜色等。

  4.结果的导出:

  ①进化树的导出:激活进化树窗口,点击工具栏中的Export Tree按钮即可将进化树保存为.Ph文件,并可被其他树编辑软件所识别。或者点击Edit菜单中的Camera命令,将图像保存到剪贴板后在Word等文档编辑软件中粘贴;

  ②序列比较结果的导出;点击Project菜单中的Export MSF Format命令,将结果保存为.msf文件后,用GeneDoc打开进一步进行编辑和修饰。

相关软件

Duplicate File Detector(重复文件搜索工具)v4.5绿色版

Duplicate File Detector(重复文件搜索工具),DuplicateFileDetector重复文件搜索工具是一款能够快速将电脑中的所有重复文件搜索出来的工具,利用DuplicateFileDetector能够搜索根据用户的标识快速搜索出文件,有需要的可以下载使用,您可以免费下载。

Tampermonkey油猴Chrome扩展v4.9官方版

Tampermonkey油猴Chrome扩展,Tampermonkey下载,Chrome的油猴插件下载。油猴是一款用户脚本管理插件,原本在火狐上发布,名字为Greasemonkey。Chrome上的类似插件就是这款Tampermonkey,它们使用的脚本是通用的,您可以免费下载。

乐学高考网课2020v2.0.8 版
乐学高考网课2020v2.0.8 版
大小: 时间:22-11-01
下载

乐学高考电脑版是北京乐学创想教育科技有限公司开发的一款高考学习软件,该软件能够为用户提供预知高考考点、免费学习视频资料等服务,有了它以后就能轻松的提高学生们的升学率,

Foxmail邮箱v7.2.23.121
Foxmail邮箱v7.2.23.121
大小: 时间:22-07-16
下载

foxmail企业邮箱是中国最著名的软件产品之一,中文版使用人数超过400万,英文版的用户遍布20多个国家,名列“十大国产软件”,被太平洋电脑网评为五星级软件。Foxmail通过和U盘的授权捆

SuperBird超鸟浏览器55.0.2878.0
SuperBird超鸟浏览器55.0.2878.0
大小: 时间:23-01-01
下载

SuperBird超鸟浏览器官方版是一款采用Chrome内核的出色软件。这款软件界面友好、操作简单、专业实用、功能全面,并具备快速的页面渲染速度,同时还内置了在线扩展商店,为用户提供了大多数常用的扩展。本站提供了这款软件的下载。

MyDock(桌面dock栏)v4.9.6官方版
MyDock(桌面dock栏)v4.9.6官方版
大小: 时间:20-10-16
下载

MyDock(桌面dock栏),MyDock桌面dock栏是一款仿Macdock栏的桌面工具,打动画流畅度比如Dock图标的鱼眼放大效果,窗口最小化效果,只保留了MacDock所有基本功能和一些简单自定义图标功能,容易上手,感兴趣的可以试试!,您可以免费下载。

本类排行榜

1
Ccleaner中文版客户端下载7.80 MB
Ccleaner中文版客户端下载7.80 MB
大小:GB
时间:18-10-16
下载
3
磁盘碎片整理(DefragExpress)1.5.0 绿色版
磁盘碎片整理(DefragExpress)1.5.0 绿色版
大小:1.89MB
时间:18-10-16
下载
4
Win10开始屏幕与开始菜单切换软件
Win10开始屏幕与开始菜单切换软件
大小:180 KB
时间:16-06-20
下载
5
windows10系统的鼠标指针打包下载
windows10系统的鼠标指针打包下载
大小:176 KB
时间:16-06-20
下载
6
Windows10远程服务器管理工具(RSAT)下载
Windows10远程服务器管理工具(RSAT)下载
大小:88 MB
时间:16-06-24
下载
7
windows10激活工具kmspico v10.0.3下载
windows10激活工具kmspico v10.0.3下载
大小:4.13 MB
时间:16-06-22
下载
8
Windows10系统术预览版发布的首个版本
Windows10系统术预览版发布的首个版本
大小:3.74 GB
时间:16-06-17
下载
9
Win10 Modern版WinZip已公布可下载
Win10 Modern版WinZip已公布可下载
大小:3.74 GB
时间:16-07-18
下载
10
IDM下载器最新版 V6.22免费下载
IDM下载器最新版 V6.22免费下载
大小:3.74 GB
时间:16-07-18
下载