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Oligo DNA是什么? oligo如何确定退火温度?

时间:2024-05-12 04:12:50 来源:Windows10之家 作者:admin

Oligo DNA是什么?

Oligo DNA / RNA是人工设计的一小段DNA / RNA,Oligo DNA / RNA的核酸片段,通常在20nt。

它们可以作为引物,PCR,测序,DNA微阵列,Southern杂交,荧光原位杂交(FISH)等用途上。

oligo如何确定退火温度?

熔解温度(Tm)是引物的一个重要参数。这是当50%的引物和互补序列表现为双链DNA分子时的温度.Tm对于设定PCR退火温度是必需的。在理想状态下,退火温度足够低,以保证引物同目的序列有效退火,

同时还要足够高,以减少非特异性结合。合理的退火温度从55℃到70℃。退火温度一般设定比引物的

Tm低5℃。

设定Tm有几种公式。有的是来源于高盐溶液中的杂交,适用于小于18碱基的引物。

有的是根据GC含量估算Tm。确定引物Tm最可信的方法是近邻分析法。这种方法从序列一级结构和相邻碱基的特性预测引物的杂交稳定性。大部分计算机程序使用近邻分析法。

根据所使用的公式及引物序列的不同,Tm会差异很大。因为大部分公式提供一个估算的Tm值,所有退火温度只是一个起始点。可以通过分析几个逐步提高退火温度的反应以提高特异性。开始低于估算的Tm5℃,以2℃为增量,逐步提高退火温度。较高的退火温度会减少引物二聚体和非特异性产物的形成。

为获得最佳结果,两个引物应具有近似的Tm值。引物对的Tm差异如果超过5℃,就会引物在循环中使用较低的退火温度而表现出明显的错误起始。如果两个引物Tm不同,将退火温度设定为比最低的Tm低5℃

或者为了提高特异性,可以在根据较高Tm设计的退火温度先进行5个循环,然后在根据较低Tm设计的退火温度进行剩余的循环。这使得在较为严紧的条件下可以获得目的模板的部分拷贝。

oligo多少度储存?

Oligo是通过紫外分光光度计在260nm波长下定量的,因此必须在配置引物溶液前,详细参考报告单中每条Oligo的分子量、OD数、每OD的nmol数、Tm值等参数,计算出相应量后才能配置。比如若您要溶解多少umol的溶液,应该加入多少ml的ddH2O或TE充分溶解。

经过真空干燥的Oligo呈薄膜状或粉末状附在离心管内壁上,使用时,请将引物离心数秒,使 DNA 聚集到管底。小心开启管盖,以免引起粉末丢失。再加入适量ddH2O或TE缓冲液,盖好管盖,涡旋振荡混匀使其充分溶解。

使用过程中,请尽量减少Oligo溶液的冻融次数,以降低Oligo在冻融过程中的降解量。

请把 Oligo 产品放置在-20℃保存,干粉引物至少可以稳定保存1年,引物溶液可以稳定保存6个月以上。

什么是益生元(OLIGO)?

益生菌是一种对人体有益的活性微生物,它可以直接作用于肠道,可调节宿主免疫功能和调节肠道内菌群平衡,促进营养吸收保持肠道健康。其中就有乳酸菌和双歧杆菌等。

而益生元是一种不能被肠道直接吸收的膳食补充剂,但可以通过刺激益生菌生长和保持活性从而间接地对人体产生影响。可以说是益生菌的“食物”,是没有生命的。

对于免疫力尚未成熟的宝宝来说,益生元就更重要了。因为初生婴儿体内益生菌有效,而益生元可以促使益生菌的生长繁殖,帮助宝宝建立初期自身微生态。从而增强免疫功能、维护肠道健康。但目前市面上含有益生元的产品较少,在这一方面做的最为优秀的是life space这个品牌。含有菌株15种,每袋含有100亿CFU活菌。而且最重要的是它还含有益生元,可以促进人体内的有益菌生长和保持长久活性。

oligo是什么化妆品牌?

幽兰是来自法国的中高档护肤品,在国内知名度相对较小,这款Orlane 幽兰 Oligo Vitamin 全效亮肌营养乳霜以红石榴干细胞及Cellular Life Complex为主要成分,蕴含多种矿物质、微量元素和维他命等,可有效为肌肤补充营养、促进细胞排毒再生及抗氧化,保护及加强肌肤防御力

oligo calc如何看引物好坏?

1、duplex formation:这是评价引物二聚体形成的,包括自身形成二聚体和引物间二聚体,主要是看引物3‘端有无配对碱基(最好没有)。其中的current oligo是当你对引物进行了编辑(如加入酶切位点)时,对原始引物进行的分析。(下同)形成的二聚体要看能值G(得它不会输入啊!),能值越低越好,最好不要超过4.5(下同)

2、hairpin formation:是看引物自身能否形成发夹结构,主要也是看3’端不要形成发夹结构。还要看形成发夹结构的能值,不超过4.5。如果引物中加入酶切位点,可能会有发夹结构且能值不会太低,这就需要灵活控制退火温度了。

3、composition and Tm:分析上下游引物的碱基组成,GC比和Tm值,原则我就不多说了。

4、false priming site: 如果模板不是基因组DNA,而是一个特定模板序列,需要进行错配的分析,看你的引物(尤其3‘端)是否与特定模板的其他位点结合。一般错配的引发效率以不超过100为好,但并不绝对,如果正确结合位点的引发效率为450以上,而有一个错配的引发效率是120左右的,这个引物也是可以接受地!!

Oligo DNA/RNA是什么?寡聚核苷酸?

A,C,T,G就是DNA的四种脱氧核糖核酸的四种碱基部分,C是胞嘧啶,dC表示的是胞嘧啶与脱氧核糖结合形成的脱氧核糖核苷酸,oligodC则表示由胞嘧啶组成的脱氧寡核苷酸链,(oligo是“少“的意思,即只含有几个碱基的短链),ddC表示的是胞嘧啶与双脱氧核糖结合形成的双脱氧核糖核苷酸